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一、基本信息
英文称呼:H-Ala-D-Glu(Lys-D-Ala-D-Ala-OH)-OH
汉文称呼:丙氨酰 - D-γ- 谷氨酰 - 赖氨酰 - D - 丙氨酰 - D - 丙氨酸(汉文名可能因定名功令及风俗存在其他表述)
氨基酸序列:从 N 端至 C 端为丙氨酸 - D-γ- 谷氨酰胺 - 赖氨酸 - D - 丙氨酸 - D - 丙氨酸 ,即 Ala - D - γ - Glu - Lys - D - Ala - D - Ala 。在肽聚糖前体结构中,它以特定长入方式参与组成更大分子结构,其中 γ- 谷氨酸的 γ- 羧基参与肽键造成 。
单字母序列:A - D - γ - E - K - D - D
三字母序列:Ala - D - γ - Glu - Lys - D - Ala - D - Ala
分子量:488.535
分子式:C₂₀H₃₆N₆O₈
等电点:约 9.71 。该多肽含有多个可解离基团,其中赖氨酸的 ε- 氨基(pKa 约 10.5)呈碱性,天冬氨酸的羧基(pKa 约 4.0)呈酸性,通过有关计较模子,联接这些氨基酸的 pKa 值以及多肽所处环境,可估算出其等电点。当环境 pH 为等电点时,多肽举座呈电中性 。
伸开剩余80%CAS 号:2614 - 55 - 3
供应商:上海楚肽生物科技有限公司
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二、结构信息
Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 是由 5 个氨基酸残基组成的短肽。在一级结构上,氨基酸通过肽键按序持续,造成线性结构 。与常见多肽不同的是,其谷氨酸残基为 D 型且是 γ- 羧基参与肽键造成,而很是见的 α- 羧基,这种非凡长入方式影响了肽链的空间走向 。
从二级结构看,由于肽段较短,难以造成典型的 α- 螺旋、β- 折叠等功令二级结构。但氨基酸残基间可通过氢键、范德华力等弱互相作用,产生局部构象倾向,如可能造成一些 β- 转角结构,使肽链出现鬈曲 。
三级结构中,带正电的赖氨酸残基和带负电的 D-γ- 谷氨酸残基的侧链基团互相作用,会影响肽链的折叠方式,同期丙氨酸的甲基侧链也会影响分子的空间填充和举座形态 。举座而言,其结构特质与细菌肽聚糖前体结构概述有关,在肽聚糖合成经由中,该五肽尾可与其他肽聚糖身分(如 N - 乙酰胞壁酸等)长入,构建起复杂的肽聚糖网状结构 。
三、作用机理及酌量进展
作用机理:Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 是肽聚糖前体 UDPMurNAc-l-Ala-γ-d-Glu-l-Lys (Gly)(5)-d-Ala-d-Ala 的五肽尾 。在细菌细胞壁合成经由中,它参与肽聚糖的拼装。最初,UDP-N - 乙酰胞壁酸五肽(含此五肽尾)与 N - 乙酰葡萄糖胺联接造成双糖亚单元,随后这些双糖亚单元在细胞膜上徐徐团员,并通过转肽作用造成交联的肽聚糖网状结构,赋予细菌细胞壁强度和表露性 。此外,它已经 D - 丙氨酸羧肽酶(muramoylpentapeptide carboxypeptidease)的底物,该酶可催化其 C 端 D - 丙氨酸的水解,在细菌细胞壁代谢及督察细胞壁结构完好性方面分解作用,影响细菌的助长、分手等生理经由 。
酌量进展:面前对 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 的酌量多鸠合在细菌细胞壁合成机制范围。通过对其在肽聚糖合成路线中的作用酌量,有助于长远贯通细菌细胞壁的构建经由,为配置新式抗菌药物提供表面基础 。有酌量运用同位素记号技巧跟踪该五肽尾在肽聚糖合成中的代谢旅途,明确其参与肽聚糖拼装的具体门径和关键酶促反馈 。在抗菌药物研发方面,以干涉该五肽尾参与的肽聚糖合成经由为靶点,筛选和贪图不详扼制有关酶活性(如转肽酶、D - 丙氨酸羧肽酶等)的化合物,有望配置出新式抗菌药物,处置日益严重的细菌耐药问题,但现在有关药物仍处于酌量阶段,距离临床应用还有诸多问题需要处置,如药物的安全性、灵验性、药代能源学本性等 。
四、溶化保存
溶化:
体外践诺溶化:可尝试使用无菌超纯水溶化,若溶化性欠安,可探讨使用二甲基亚砜(DMSO)。但需肃肃,DMSO 可能对某些生物践诺产生影响,使用前应进行对照践诺评估 。在一些酶活性检测践诺中,还可笔据践诺要求将其溶化于特定缓冲液,如磷酸盐缓冲液(PBS,pH7.4),以督察合适的 pH 值和离子强度,保证多肽的表露性和生物活性 。
体内践诺有关溶化(动物践诺等应用):关于体内应用,常将其溶化于生理缓冲液,如生理盐水(0.9% NaCl 溶液)或与体内环境更接近的缓冲体系。同期,要肃肃溶液的无菌处理,防范微生物混浊,影响践诺恶果 。
保存:
干粉保存:始终保存时,将 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 以冻干粉相貌置于密封容器中,存放在 - 20°C 或更低温度(如 - 80°C)环境下,可减少多肽降解,延迟保存时候。同期,肃肃避光,幸免光照激发可能的化学反馈 。
溶液保存:若配制成溶液,需进行分装,幸免反复冻融,因为冻融轮回可能导致多肽结构碎裂、活性缩小。在 - 20°C 条目下,溶液可保存数月;在 - 80°C,保存时候可允洽延迟,但具体时长会因保存条目和溶液身分略有各异 。从雪柜取出溶液使用时,应良晌离心,使溶液鸠合于管底,再开启取用,防范溶液蒸发和混浊 。
五、有关多肽
革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌肽聚糖四肽尾有关多肽:革兰氏阳性菌肽聚糖四肽尾组成一般为 L-Ala + D-Glu + L-Lys + D-Ala ,革兰氏阴性菌为 L-Ala + D-Glu + m-DAP(内消旋二氨基庚二酸) + D-Ala 。与 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 对比,它们在氨基酸种类和陈设上既有一样性又有各异,酌量这些各异有助于贯通不同类型细菌细胞壁结构及合成机制的特质 。
基于肽聚糖合成路线的其他关键多肽:如 UDP-N - 乙酰胞壁酸五肽中,除了包含 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 这一五肽尾的相貌外,还有不同氨基酸组成或修饰的五肽尾变体,酌量这些变体多肽在肽聚糖合成中的作用及与 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 的互有关联,可进一步显然肽聚糖合成路线的复杂性和各种性 。
六、有关文件
[1] Foley TD尊龙凯时体育, et al. Oxidative inhibition of protein phosphatase 2A activity: role of catalytic subunit disulfides. Neurochem Res. 2007 Nov;32 (11):1957 - 64.
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